Page 8 - TT_TEKVAK_Natalia Rara_175090101111028
P. 8
IV (DPP4, juga dikenal sebagai CD26 manusia). Menariknya, MERS-RBD dapat menginduksi
produksi kuat antibodi in vivo, yang menunjukkan bahwa protein S memiliki imunogenisitas yang
baik untuk induksi antibodi penawar (nAbs). Imunogenisitas dan potensi perlindungan NTD telah
dipelajari, dan domain N-terminal rekombinan (rNTD) adalah kandidat vaksin melawan MERS
(Li dkk., 2018).
Ada dua daerah dalam subunit S2 yang berpartisipasi dalam fusi virus, yaitu,
Heptapeptide Repeats 1 dan 2 (HR1 dan HR2), yang berkumpul menjadi bundel enam-helix (juga
disebut inti fusi). Tiga rantai HR2 di inti alur sisi HR1 memancarkan tiga spiral HR1, membentuk
inti spiral pusat melingkar yang merupakan struktur fusi membran kunci. Setelah pengikatan S1
dan DPP4, HR1 mengikat HR2 untuk membentuk struktur perantara sementara, menyebabkan
virus dan membran sel bergerak mendekat untuk berfusi. Protein S juga memainkan peran kunci
dalam tropisme dan morbiditas CoV, dengan proteolisis antara S1 dan S2. Ada banyak jenis
protease pada inang yang dapat mencerna protein S dari MERS-CoV. Sebagai contoh, furin dapat
digunakan dalam dua cara oleh MERS-CoV dalam proses aktivasi pemotongan selama infeksi.
Pertama, furin mengenali posisi R751/S752 dan memotong protein S selama biosintesis.
Selanjutnya, S2 dicerna lebih lanjut ke S20 pada posisi R887/S888, yang berdekatan dengan fusi
peptida setelah masuknya virus (Li dkk., 2018).
Protein membran virus merupakan bagian penting dalam perakitan vrus, pembentukan
envelop serta pembentukan inti virus dengan berinteraksi dengan protein nukleokapsid. Oleh
karena itu, pengembangan peptide fusi dan IFN antagonis dapat menjadi opsi perawatan yang
penting. N-terminus protein N (residu 39–165) dipredikis merupakan daerah pengikatan RNA, dan
terminal-C merupakan daerah pembentukan self-binding-oligomer. Perbandingan homologi antara
MERS-CoV dan CoV lainnya menunjukkan bahwa walaupun protein N memiliki homologi yang
rendah terhadap seluruh sekuens asam amino, sekuens asam amino lokal tertentu - terutama
sekuens asam amino terminal N - sangat dilestarikan. Protein N dapat meningkatkan replikasi
dengan overekspresi. Struktur nukleokapsid tidak hanya membutuhkan pengenalan urutan
karakteristik dari RNA virus, tetapi juga harus mengenali ikatan dengan protein virus struktural
lainnya (Li dkk., 2018).
MERS-CoV juga memiliki protein asesoris yang dikode oleh dORF: ORF3, ORF4a,
ORF4b, ORF5. ORF protein asesoris penting untuk replikasi virus. Sehingga protein asesoris ini
merupakan target potensial untuk pemantauan dan perawatan terapeutik. Pelemahan fungsi dari
